משרד החוקר הרפואי מנהל את כל פעולות החקירה ברחבי המדינה. הוכשר והוסמך במיוחד סגן חוקרי הרפואה בשטח (FDMI) מבצע חקירות שטח.
בכל מחוז בניו מקסיקו יש FDMI שמבצעים חקירות בזירת המוות כדי לאסוף מידע המשמש לקביעת שיפוט, סיבה אפשרית ואופן מוות, ובהעדר רופא מספקים את הכרזת המוות, כמו גם לקחת משמורת על הגוף מוכן להובלה למשרדנו באלבוקרקי, שם ניתן לבצע נתיחה.
לעתים קרובות הם נוסעים לזירת מקרי מוות, התאבדויות, מקרי מוות מקריים, מפוקפקים ו/או ללא השגחה, ומבצעים חקירות במקום כנדרש על ידי צילום תמונות, גופי טביעות אצבע ועיבוד ראיות מטעם משרד החוקר הרפואי. (OMI).
ה- FDMI מציגים את תוצאות כל חקירה לסגני חוקרי הרפואה המקבלים את ההחלטות הסופיות בנוגע לסמכות השיפוט ולצורך בחקירה רפואית נוספת.