חקירות מאפשרות אוסף עובדות סביב כל מקרי המוות הלא טבעיים או הבלתי מוסברים; עובדות אלו מסייעות לחוקר הרפואי לקבוע את סיבת המוות ואופן המוות. חקירות מסייעות גם בקביעת סכנות סביבתיות אפשריות, הפרות בטיחות בעבודה, סכנות של מוצרי צריכה ואיומים על בריאות הציבור.
למקרים שנכללים בסמכות השיפוט של OMI (ראה: מקרי מוות שניתן לדווח), משפחות לא משלמות דבר עבור שירותי חוקר רפואי או עבור ההסעה לאלבוקרקי לנתיחה. זה כולל גם שירותי אבל. משפחות עשויות להיות מחויבות עבור ההסעה לבית הלוויות שהן בוחרות. התייעצות ניתן לבקש גם נתיחה שלאחר המוות על חשבון המבקש.
החקירה תתחיל במקום המוות. המשטרה תזמין חוקרים רפואיים שהוכשרו במיוחד. החוקר ישוחח עם בני משפחה, עדים ואחרים, יעבוד עם המשטרה בזיהוי תכונות המוות, ישיג היסטוריות רפואיות ותיעודים ויצלם את זירת המוות. החוקר יאשר את הוצאת הגופה למקום בו תיערך בדיקה.
לעתים קרובות בוצעה זיהוי בזירת המוות. במקרים שבהם אנשים נותרים בלתי מזוהים, או שבהם זיהוי קשה עקב מצבו של הגוף, נעשה שימוש בטביעות אצבע, רישומי שיניים וצילומי גוף, בנוסף לראיות הנתיחה, לזיהוי אדם.
כן. לאחר שבני המשפחה הביעו התעניינות, רכזי תוכנית התורמים של בנק האריות וניו מקסיקו עובדים בשיתוף פעולה הדוק עם החוקר הרפואי, ויבדקו את נאותות קציר האיברים עם החוקר הרפואי לפני שיאפשרו לבני המשפחה להסכים באופן רשמי לתרומה. הליכים להשגת איברים ורקמות נעשים בתוך חדרי הניתוח של בית החולים, ולא במשרד החוקר הרפואי. להיות קורבן לרצח או מוות טראומטי אחר אינו מונע להיות תורם. כל המקרים לתרומת איברים דורשים הסכמה משפחתית.
בכל המקרים תיחתם תעודת הפטירה בסיום החקירה. סיבת המוות ואופן המוות יהיו בתעודה. דוחות רשמיים זמינים בדרך כלל שמונה עד שנים עשר שבועות לאחר ביצוע האבחנה הסופית, אם כי חלקם עשויים להימשך זמן רב יותר. חלק מאלה ניתן לבקש כאן.