ערך פרוגנוסטי ודפוסי ביטוי משותף של מסלולים מטבוליים בסרטן

דן ג'אנג, יאן גואו וני שי | דצמבר 29, 2020
רקע: מסלולים מטבוליים לא תקינים נחשבו כאחד מסימני ההיכר של סרטן. בזמן
מסלולים מטבוליים רבים נחקרו בסוגי סרטן שונים, הקשר הישיר בין מסלול מטבולי
ביטוי גנים ופרוגנוזה של סרטן לא הוכח.
תוצאות: באמצעות שתי שיטות ניתוח ביואינפורמטיקה שפותחו לאחרונה, הערכנו את פוטנציאל הפרוגנוזה של
ביטוי מסלול מטבולי וחוסר ויסות גידול לעומת נורמלי עבור עד 29 מסלולים מטבוליים ב-33 סרטן
סוגים. התוצאות מראות שביטוי גנים מטבולי מוגבר בתוך גידולים תואם לפרוגנוזה גרועה של סרטן.
ניתוח מטא דיפרנציאלי של ביטוי משותף זיהה ארבעה מסלולים מטבוליים עם ביטוי משותף גלובלי משמעותי
הפרעת רשת בין הגידול לדגימות תקינות. ניתוח ביטוי דיפרנציאלי של מסלולים מטבוליים
הדגימה גם הפרעה חזקה בביטוי גנים בין גידול מזווג לדגימות נורמליות.
סיכום: בסיכומו של דבר, תוצאות אלו הצביעו מאוד על כך שביטויי גנים של מסלול מטבולי הם
מופרע לאחר גידול גידולים. בתוך גידולים, מסלולים מטבוליים רבים מווסתים להפעלת תאי הגידול
מטבוליזם תואם לשמירה על האנרגיה הדרושה לחלוקת התא.
מילות מפתח: מסלול מטבולי, ניתוח מטא ביטוי משותף, ציון מורכב של ביטוי גנים, סרטן

האוטו -זיגוסיות העולמית קשורה בסיכון לסרטן, חתימה מוטציות ופרוגנוזה

Limin Jiang, Fei Guo, Jijun Tang, Shuguan Leng, Scott Ness, Fei Ye, Huining Kang, David C. Samuels and Yan Guo | דצמבר 04, 2020
אוטוזיגוטיות עולמית בצורה של ריצות של הומוזיגוזיות קשורה למחלות שונות. יחס הטרוזיגוסיות, מדד חלופי לאוטוזיגוטיות גלובלית, משמש להערכת הסיכון לסרטן במחקר זה. הניתוח שלנו מראה קשרים חזקים ועקביים בין יחסי הטרוזיגוסיות וסוגי סרטן שונים. ניתוח נוסף מגלה את הקשרים הפוטנציאליים של יחס ההטרוזיגוסטיות לחתימות מוטציות ותחזית סרטן.