משרד ההשכלה הרפואית לתארים מתקדמים (GME) באוניברסיטת ניו מקסיקו מנהל 76 תוכניות התמחות ומלגות, 74 תוכניות המוסמכות על ידי מועצת ההסמכה לחינוך רפואי לתארים מתקדמים (ACGME), תוכנית אחת המוסמכת על ידי הוועדה להסמכת רופאי שיניים (CODA), ותוכנית אחת המוסמכת על ידי הוועדה להסמכת תוכניות חינוך לפיזיקה רפואית (CAMPEP).
לאחר סיום לימודי הרפואה, מתמחים יכולים להיכנס לאחת מתוכניות ההתמחות המרכזיות שלנו. עם סיום תוכנית הליבה, רופאים רבים בוחרים להתמחות נוספת באמצעות אחת מהזדמנויות התמחות הרבות שלנו בתחום התמחות המשנה. כל תוכנית GME מובלת על ידי מנהל תוכנית ייעודי ונתמכת על ידי רכזי תוכנית וסגל מנוסים.
נקודות של גאווה