תחומי התמחות

המחקר במעבדת אוסלי מתמקד בתפקידו של הכרומטין בביטוי גנים, שכפול DNA ותיקון שבירת גדילים כפולה של DNA. אנו משתמשים באורגניזם המודל, Saccharomyces cerevisiae, כדי לחקור תהליכים סלולריים אלה בתאים שקטים, המייצגים תאים לא צומחים אך קיימא הנמצאים בשלב G0 של מחזור התא.osley-1.jpeg

האפיגנום של תאים שקטים: באמצעות גישות גנומיות, המחקרים האחרונים שלנו התמקדו בתפקיד הכרומטין בפיתוח תאים שקטים שנוצרים בשלב נייח בעקבות דלדול הגלוקוז. מחקרים אלה הראו שמירה של מספר סימני מתילציה של היסטון ו- RNA פולימראז II על גנים לא פעילים בתאים שקטים, דבר המצביע על כך שהאפיגנום של תאים שקטים מרגיע את התאים הללו לחדש את הצמיחה כאשר החומרים המזינים משוחזרים.

תאי שמרים שקטים הם גם מודל מצוין לחקר תוחלת החיים הכרונולוגית. אנו מבצעים מסך גנטי עבור מוטציות לשינוי היסטון לזיהוי שינויים שלאחר תרגום היסטון הנדרשים להתפתחות תאים שקטים והישרדותם לאורך זמן.

תוכנית שכפול DNA של תאים שקטים: תאים שקטים נכנסים מחדש למחזור התא ומחזקים את החלוקה לאחר שחזור הגלוקוז. באמצעות גישות מולקולריות, גנטיות וגנומיות, אנו מגדירים את התוכנית שיוזמת שכפול DNA בתאי G0 מרגיעים בתנאים אלה ומשווים אותו לתוכנית המתרחשת כאשר תאי G1 נכנסים לשלב S. הנתונים שלנו מצאו הבדלים משמעותיים בתוכניות חניכת ה- DNA בין תאי G1 ו- G0.

תיקון DNA בתאים שקטים: תאים שקטים עמידים בפני גורמים רבים המזיקים ל- DNA אך רגישים יותר לקרינת UV מאשר תאים צומחים וצוברים יותר מוטציות בגנום שלהם. אנו מבצעים ניתוחים מולקולריים, גנטיים וגנומיים כדי להגדיר את המסלולים והמנגנונים התורמים להגברת המוטגנזה המושרה מ- UV בתאים אלה.

פרסומים מרכזיים

יאנג, CP, Hillyer, C, Hokamp, ​​K, Fitzpatrick, DJ, Konstantinov, NK, Welty, JS, Ness, SA, Werner-Washburne, M, Fleming, AP ו- אוסלי, MA: פרופיל מתילציה היסטוני ופרופילי שעתוק היסטון נקבעים במהלך התפתחות השקטה הסלולרית בשמרים. BMC Genomics. 26 בינואר; 18 (1), 2017.

Wiest, NE, Houghtaling, S, Sanchez, JC, Tomkinson, AE ו- אוסלי, MA. שיפוץ נוקלאוזום תלוי ה- SWI/SNF ATP מקדם אתחול הכריתה בהפסקה של DNA דו-גדיליים בשמרים. מחקר חומצות גרעין 45: 5887-5900, 2017.

Trujillo, KT ו אוסלי, MA: תפקיד לכל מקום H2B בשכפול DNA, Mol Cell, 48: 734-746, 2012.

Shieh, GS, Pan, CH, Wu JH, Sun, YJ, Chang, KW, Tung, L, Chang, TH, Fleming, A, Hillyer, C, Berger, SL, אוסלי, MA* וקאו, CK*: כל מקום H2B הוא חלק מארכיטקטורת הכרומטין שמסמנת את מבנה האקסון-אינטרון בשמרים המתהווים. BMC Genomics. 22 בדצמבר; 12 (1): 627 [epub לפני ההדפסה], 2011.

Houghtaling, S, Tsukuda, T ו- אוסלי, MA: מבחנים מולקולריים לחקור שינויי כרומטין במהלך תיקון שבירה של שני גדילים ב- DNA בשמרים. שיטות בביולוגיה מולקולרית, 745: 79-97, 2011.

Nakanishi, S, Lee, JS, Gardner, JM, Takahashi, Y, Chandrasekharan, Sun, ZW, אוסלי, MA, Strahl, B, Jasperson, SL, Shilatifard, A: היסטון H2BK123 monoubiquitination הוא הקובע הקריטי עבור H3K4 ו- H3K79 trimethylation על ידי COMPASS ו- Dot1. תאיל ביאול, 186: 371-377, 2009.

Tsukuda, T, Lo, YC, Krishna, S, Sterk, R, אוסלי, MA, וניקולוף, J: שיפוץ הכרומטין תלוי ב- INO80 מסדיר שלבים מוקדמים ומאוחרים של רקומבינציה הומולוגית מיטוטית. תיקון DNA, 8: 360-360, 2009.

פלמינג, א.ב., קאו, CF, הילרר, ג, פיקאארט, מ אוסלי, MA: כל מקום H2B ממלא תפקיד בדינמיקה של נוקלאוזום במהלך התארכות התעתיק. תא מול, 31: 57-66, 2008.

שיאו, X, קאו, CK, קרוגן, N, גרינבלט, J, שמש, ZW, אוסלי, MA, ושטראל, ב ': כל מקום הנמצא תלוי Rad6 של H2B קשור להארכת פולימראז RNA II.  מול. תָא. ביול. 25: 637-651, 2005.

Tsukuda, T, Fleming, A, Nickoloff, JA, and אוסלי, MA: שיפוץ כרומטין באתר שבירת DNA של שני גדילים Saccharomyces cerevisiae. טֶבַע 438: 379-383 2005.